Pour construire des tableaux de spectres, avec des bactéries en colonne et des antibiotiques en ligne, il faut pouvoir inscrire une valeur de sensibilité dans chaque intersection et donc disposer d'informations sur chaque couple (bactérie, antibiotique) possible.

Les valeurs des spectres sont récupérées à partir du document émis par l'Afssaps sur les spectres antibactériens.

Lorsque l’on regarde ce document, on s’aperçoit que le spectre de l’antibiotique peut être défini

•  pour une espèce bactérienne(Escherichia coli),
•  pour un genre bactérien (Acinetobacter),
• pour un groupe de bactéries (staphylocoques à coagulase négative, cocci gram positif),
• pour un groupe de bactéries avec des exclusions (bacilles gram négatif aérobies à l’exclusion de Aeromonas hydrophila).

Pour construire la valeur du spectre entre une bactérie donnée et un antibiotique donné, l'algorithme d'AntibioCarte recherche l'existence d'information

• en recherchant la bactérie donnée dans le document Afssaps (exemple: Escherichia coli)
• en recherchant tous ses synonymes tels qu'ils sont exprimés dans le documents afssaps (exemple: E. coli)
• en recherchant tous ses pères tels qu'ils sont exprimés dans le document Afssaps (exemple: entérobactéries, bacilles gram négatifs aérobie...)

Le système étend donc la requête initiale en utilisant les relations de synonymie et de hiérarchie que le terme identifiant la bactérie sélectionnée entretient avec les autres termes.

Grâce à AntibioCarte,  le médecin généraliste peut avoir une vue explicite des spectres antibactériens et une présentation lui permettant la comparaison et la lecture rapide, et ceci sans avoir mobilisé de savoir sur les éléments taxonomiques utilisés en microbiologie.